1996年4月3日、株式会社ビジュアルサイエンス研究所の3DCG技術を活用したコンピュータゲーム開発会社として設立された。設立時の代表取締役社長は吉岡賢。社名は「3DCG（⇒ポリゴン）で、世界中の子供たちを魔法（⇒マジック）にかけたい」という想いから命名された。

2007年1月1日付けで、グリッドオンプット技術を有するグリッドマークの完全子会社となった。

2008年1月1日、鶴谷武親が代表取締役社長に就任。